Svaki od prethodno navedenih načina registracije preduzetnika i plaćanja poreza ima svoje prednosti i mane. Najbolji oblik plaćanja poreza za tebe zavisi od tvoje konkretne poslovne situacije, ali opšti principi su sledeći: Ako misliš da ćeš imati stabilne godišnje prilive do 6.000.000 dinara i nije ti neophodno da budeš u sistemu PDV-a, onda je najverovatnije za tebe najbolja opcija paušalno oporezivanje. Ako ipak misliš da će tvoji godišnjih prihodi biti iznad 6.000.000 dinara, onda moraš da vodiš poslovne knjige.

Kada se opredeljuješ za opciju između preduzetnika sa samooporezivanjem i preduzetnika sa isplatom zarade, treba da uzmeš u obzir projekciju tvojih prihoda kako bi mogao da oceniš da li su oni dovoljni da isplaćuješ sebi zaradu. S jedne strane, iznos zarade koji isplaćuješ sebi smatraće se troškom i za taj iznos će se umanjiti oporezivi prihod koji ostvariš u svom poslovanju. S druge strane, ta zarada nije oslobođena od plaćanja poreza i doprinosa na mesečnom nivou.

Kod vođenja poslovnih knjiga, treba imati u vidu da je u tom slučaju za svaku radnju potreban račun kako bi se pravdali poslovni rashodi. Takođe, tu su i dodatni troškovi angažovanja računovođe. Sa druge strane vođenje knjiga bez prijavljene zarade može odgovarati delatnostima gde postoje visoki poslovni rashodi (npr. kupovina materijala ili renta prostora).